Den gula cirkeln är en symbol för
månen. Fullmånen sägs tradionellt vara den bästa tidpunkten för att så, fiska och även hålla bröllop. Den står även för lugn, fred och kärlek. Flaggans ljusblåa färg representerar landets oberoende och ses även som en anslutning till
Mikronesiens federerade staters flagga och
FN-flaggan.
Palau hörde tidigare till Mikronesiens federerade stater, som dessförinnan var en del av
USA:s Stillahavsprotektorat. När sedan Mikronesiens federerade stater blildades och blev självständiga år 1978, valde Palau att vara utanför. Deras flagga antogs den 1 januari år 1981 i samband med att de blev en republik. Självständigheten nådde Palau först år 1994.