Komorernas flagga blev antagen först på 2000-talet. På nyårsafton år 2001 antogs flaggan med proportinerna 3:5. Flaggan består av fyra horisontella fält i färgerna gult, vitt, rött och blått och med en grön triangel vid flaggans inre kant. Inuti triangeln är det en vit halvmåne och fyra stycken femuddiga stjärnor som är vita. Banden representerar landets fyra huvudöar: Moheli, Njazidja, Ndzuwani och Mayotte. Även de fyra stjärnorna representerar huvudöarna.
Ön
Mayotte tillhör fortfarande
Frankrike men Komorerna anser att den är deras och bör tillhöra deras land. Halvmånen, stjärnorna och den gröna färgen är traditionella symboler för islam. Flaggan är baserad på en tidigare flagga som skulle symbolisera ögruppens socialistiska ideologi.